Фільм розкриває обставини арешту, ув’язнення та звільнення Патріарха Української Греко-Католицької Церкви Йосифа Сліпого. Героями кінострічки стали також Папа Іван ХХІІІ, президент США Джон Кеннеді, генеральні секретарі ЦК КПРС Йосип Сталін та Микита Хрущов. Назву фільмові дала агентурна справа «Рифи», що зберігається в архіві СБУ України і налічує 33 томи. В ній задокументовано, як радянська влада розробляла і втілювала в життя план знищення Української Греко-Католицької Церкви та її Глави Йосифа Сліпого. Ці документи стали основою фільму, до якого увійшли свідчення учасників та очевидців подій, коментарі істориків з України, Італії, США, унікальні кадри кінохроніки з українських та іноземних кіноархівів.